藏經閣底層為佛教文化展覽廳；閣首層與三層為禪堂，是瑜伽行者坐禪行禪的靜修之處。閣二、四、五層為圖書館，藏有佛教三藏圣典，及文史哲科圖書。佛教三藏中，經藏主要記述佛陀在某時某地對特定人群做出的具體修行指導，律藏主要記述佛陀在某時某地制定的具體戒律守則，論藏則是用術語嚴謹、系統、普遍化地闡釋義理。